- Isis-fish-users - mailman.cloud.codelutin.com

Efficacité technique
by Paul MARCHAL Dec. 13, 2011

Dec. 13, 2011

Bonjour, Je voudrais savoir comment le paramètre "efficacité technique" (dans l'onglet flottilles) affecte la mortalité par pêche. Pourriez vous m'indiquer où trouver les lignes de code correspondantes? Merci Paul -- Paul Marchal IFREMER RBE/HMMN 150, Quai Gambetta BP 699 62321 Boulogne sur mer FRANCE Tel: (+33) 321 99 56 86 Fax: (+33) 321 99 56 01 Mail: paul.marchal(a)ifremer.fr

2 2

Re: [Isis-fish-users] erreur lors de calibration
by Bastien Preuss Dec. 13, 2011

Dec. 13, 2011

Bonjour Eric, Il s'agit du passage où j'écris dans le fichier .csv les résultats du calcul de critère. J'ai repris ce bout de code du code de base pour la calibration. J'ai toujours fait comme cela et ça avait toujours fonctionné. Je ne comprends pas pourquoi maintenant ça ne fonctionnerait plus. De plus je viens d'essayer sur un autre ordi et ça fonctionne, donc vraiment je ne comprends pas. Il semble y avoir un décalage entre la ligne où il essaie d'écrire et les lignes déjà remplies dans le fishiers? J'ai tout de même essayé comme tu le suggérais : history.add(result); mais j'obtiens l'erreur suivante : INFO [pool-2-thread-6] (CalibrationSimplexePasVariable2Capturabilite_Saumonee.java:481) afterSimulation - calcul du critere ERROR [pool-2-thread-6] (SimulationService.java:925) finished - Stop simulation plan, because can't call afterSimulation correctly on plan analyseplans.CalibrationSimplexePasVariable2Capturabilite_Saumonee java.lang.NullPointerException at analyseplans.CalibrationSimplexePasVariable2Capturabilite_Saumonee.afterSimu lation(CalibrationSimplexePasVariable2Capturabilite_Saumonee.java:490) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationService$PrepareSimulationJo b.finished(SimulationService.java:922) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationJob.run(SimulationJob.java: 251) at java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor$Worker.runTask(Unknown Source) at java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor$Worker.run(Unknown Source) at java.lang.Thread.run(Unknown Source) qui me renvoie à la ligne où j'affecte la valeur observée pour le calcul du critère. Merci de ton aide. Bastien -----Message d'origine----- De : isis-fish-users-bounces(a)list.isis-fish.org [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] De la part de Eric Chatellier Envoyé : samedi 10 décembre 2011 04:27 À : isis-fish-users(a)list.isis-fish.org Objet : Re: [Isis-fish-users] erreur lors de calibration Le 09/12/2011 07:00, Bastien Preuss a écrit : > > Bonjour, > > je dois reprendre certaines calibrations qui fonctionnaient très bien avant, > et maintenant, jai un bug que je narrive pas à résoudre. > > Cest une histoire dindice du numéro de simu, mais je ne vois pas où ça coince. > > Voici le message de bug (mon script de Cali est en pj) : > > Cela ne fonctionne pas car tu ajoutes dans une liste un element a une position précise : history.add(i, result); // ligne 581 Par contre, tu l'ajoute à la position 1 alors que la liste est vide. D'où l'erreur. Ce n'est pas juste : history.add(result); que tu souhaites faire ? -- Éric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users

2 1

erreur lors de calibration
by Bastien Preuss Dec. 9, 2011

Dec. 9, 2011

Bonjour, je dois reprendre certaines calibrations qui fonctionnaient très bien avant, et maintenant, jai un bug que je narrive pas à résoudre. Cest une histoire dindice du numéro de simu, mais je ne vois pas où ça coince. Voici le message de bug (mon script de Cali est en pj) : INFO [pool-2-thread-2] (MigrationServiceImpl.java:290) migrateSchema - Database is up to date, no migration needed. WARN [pool-2-thread-2] (MatrixType.java:234) splitObjects - Continuing but can't convert object in matrix isisfish.populationSeasonInfo.migration from String: 'org.nuiton.topia.persistence.TopiaEntity(fr.ifremer.isisfish.entities.Zone# 1301349218125#0.09025190928069848)' WARN [pool-2-thread-2] (MatrixType.java:234) splitObjects - Continuing but can't convert object in matrix isisfish.populationSeasonInfo.migration from String: 'org.nuiton.topia.persistence.TopiaEntity(fr.ifremer.isisfish.entities.Zone# 1301349218125#0.09025190928069848)' WARN [pool-2-thread-2] (MatrixType.java:234) splitObjects - Continuing but can't convert object in matrix isisfish.populationSeasonInfo.migration from String: 'org.nuiton.topia.persistence.TopiaEntity(fr.ifremer.isisfish.entities.Zone# 1301349218125#0.09025190928069848)' WARN [pool-2-thread-2] (MatrixType.java:234) splitObjects - Continuing but can't convert object in matrix isisfish.populationSeasonInfo.migration from String: 'org.nuiton.topia.persistence.TopiaEntity(fr.ifremer.isisfish.entities.Zone# 1301349218125#0.09025190928069848)' INFO [pool-2-thread-2] (CalibrationSimplexePasVariable2Capturabilite_Saumonee.java:234) beforeSimulation - before simulation INFO [pool-2-thread-2] (CalibrationSimplexePasVariable2Capturabilite_Saumonee.java:239) beforeSimulation - number<3 WARN [pool-2-thread-2] (SimulationJob.java:342) run - Can't simulate sim_Cali_Saumo_EffectInit4bis_Fcib0_02_FcibTaille_2011-12-09-16-36 fr.ifremer.isisfish.IsisFishRuntimeException: Can't evaluate plan script at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationService$PrepareSimulationJo b.hasNext(SimulationService.java:889) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationService$PrepareSimulationJo b.finished(SimulationService.java:933) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationJob.run(SimulationJob.java: 251) at java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor$Worker.runTask(Unknown Source) at java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor$Worker.run(Unknown Source) at java.lang.Thread.run(Unknown Source) Caused by: java.lang.IndexOutOfBoundsException: Index: 1, Size: 0 at java.util.ArrayList.add(Unknown Source) at analyseplans.CalibrationSimplexePasVariable2Capturabilite_Saumonee$Experienc es.getExperience(CalibrationSimplexePasVariable2Capturabilite_Saumonee.java: 581) at analyseplans.CalibrationSimplexePasVariable2Capturabilite_Saumonee.beforeSim ulation(CalibrationSimplexePasVariable2Capturabilite_Saumonee.java:247) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationService$PrepareSimulationJo b.hasNext(SimulationService.java:846) ... 5 more Merci de votre aide. Bastien Bastien Preuss Doctorant (PhD Student) IFREMER - IRD - Université de Nouvelle-Calédonie 101 Promenade Roger Laroque BP A5 98848 Noumea cedex New-Caledonia Tel: (+687) 260 723 P afin de contribuer au respect de l'environnement, merci de n'imprimer ce mail qu'en cas de nécessité

2 1

Re: [Isis-fish-users] Reseau ISIS-Fish - 5 et 6 Décembre 2011
by Bastien Preuss Dec. 4, 2011

Dec. 4, 2011

Salut Stéphanie, Voici les communications que j'ai faites et qui parlent de Isis. A demain. Bastien -----Message d'origine----- De : isis-fish-users-bounces(a)list.isis-fish.org [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] De la part de Stephanie MAHEVAS Envoyé : vendredi 2 décembre 2011 05:05 À : isis-fish-users(a)list.isis-fish.org; TRAVERS-TROLET; VILLANUEVA; Helene DE PONTUAL; Michel BERTIGNAC; Anik >> BRIND'AMOUR; LAFFARGUE; JADAUD; MELLON; Pierre PETITGAS; Jacques MASSE; MEHAULT; Olivier Guyader; MACHER; isis-fish-devel(a)list.isis-fish.org; LE LOCH; BANARU; Benoit BELIAEFF; Philippe.Ziegler(a)aad.gov.au Objet : [Isis-fish-users] Reseau ISIS-Fish - 5 et 6 Décembre 2011 Bonjour voici le programme final des deux journées de réunion du réseau ISIS-Fish (programme.xls). Comme vous pouvez le voir, c'est assez dense. Je vous demande donc de bien vouloir respecter le canevas de présentation (que je vous ré-attache à ce message) et de ne pas dépasser 15 minutes de présentation. Pour ceux qui nous rejoignent en visio, les codes sont dans le fichier attaché (codes.pdf). Merci de prévoir un micro et un casque au cas où il y aurait un retour de son. Merci aussi de prévoir un accès internet pour que je puisse vous envoyer sur votre boite email les documents projetés pendant la réunion. Cette réunion est aussi l'occasion de vous présenter la dernière version d'ISIS-Fish. Pour les utilisateurs d'ISIS-Fish, vous êtes invités à télécharger la Version 4 d'ISIS-Fish (un mail de Eric vous expliquera demain comment et où). La V4 et la V3 d'ISIS-Fish peuvent être lancées en même temps. Exportez depuis la V3 votre base et importez la dans la V4. Ouvrez la ensuite avec la V4. Cette ouverture de votre base va entraîner sa migration du format V3 à V4. Vous trouverez les informations nécessaires pour vous aider à migrer votre base sur le site d'ISIS-Fish http://isis-fish.org <http://isis-fish.org/>. Un créneau en fin de journée lundi est réservé aux discussions sur la V4 et à la migration des bases. Je souhaiterais faire une synthèse des communications autour d'ISIS-fish (publications, participation à des congrès, autres rapports) ainsi que des projets (avec 3, 4 lignes de description) auxquels on participe en utilisant ISIS-Fish. Pourriez-vous m'envoyer la liste de ce qui vous concerne ? Merci d'avance. Enfin un dernier point et pas des moindres, lundi soir l'Ifremer vous convie à un repas (Bistrot de l'écrivain, Nantes), merci de me confirmer votre présence. A lundi, Stéphanie ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

1 0

ISIS-Fish 4.0.0.0 est disponible !
by Eric Chatellier Dec. 2, 2011

Dec. 2, 2011

Bonjour, La nouvelle version d'ISIS-Fish 4.0.0.0 est disponible. Vous pouvez désormais la télécharger à l'adresse suivante: http://forge.codelutin.com/attachments/download/220/isis-fish-4.0.0.0-bin.z… Changements ----------- Cette nouvelle version majeure d'ISIS-Fish apporte son lot de nouveautés et de corrections. Pour plus de détails sur les nouveautés, n'hésitez pas à consulter cette page: http://www.isis-fish.org/v4/user/changements40.html. Pour la liste complète des modifications, elle est disponible ici : http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/versions/85. La documentation est maintenant disponible sur un nouveau site, entièrement dédié à ISIS-Fish: http://www.isis-fish.org/. Migration --------- Les version V4 et V3 d'ISIS-Fish peuvent être lancées en même temps. Exportez depuis la V3 votre base et importez la dans la V4. Ouvrez la ensuite avec la V4. Cette ouverture de votre base va entraîner sa migration du format V3 à V4. Vous trouverez les informations nécessaires pour vous aider à migrer votre base sur la page: http://isis-fish.org/v4/user/migrationv3v4.html. Formation --------- Les nouveautés apportées par ISIS-Fish 4 seront abordées lors des journées de formation des 5 et 6 décembre. N'hésitez donc pas à installer ISIS-Fish et à migrer vos données avant cette date. Si vous avez des questions relatives à cette nouvelle version, l'équipe de développement d'ISIS-Fish sera là pour répondre à vos questions. Cordialement, -- Éric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com

2 4

incompatible types
by Bastien Preuss Nov. 24, 2011

Nov. 24, 2011

Il semble que mon premier message ait été bloqué : Bonjour, Dans un script jutilise le code suivant : List<Strategy> liststrat = L2.getSemantic(1); int[] indexStratagarder = new int[2]; for(Strategy s : liststrat){ if(s.getName().equals("PRO_Ligne_GN")) indexStratagarder [1] = listmet.indexOf(s); else if(s.getName().equals("PRO_Ligne_CS")) indexStratagarder [2] = listmet.indexOf(s); } Mais jobtiens lerreur suivante : Incompatible types found : java.util.List<capture#513 of ?> required : java.util.List<fr.ifremer.isisfish.entities.Strategy> List<Strategy> listStrat = L2.getSementic(1); Jai pourtant bien fait le Import fr.ifremer.isisfish.entities.*; Du coup je ne vois pas doù vient lerreur. Merci de votre aide. Bastien Bastien Preuss Doctorant (PhD Student) IFREMER - IRD - Université de Nouvelle-Calédonie 101 Promenade Roger Laroque BP A5 98848 Noumea cedex New-Caledonia Tel: (+687) 260 723 P afin de contribuer au respect de l'environnement, merci de n'imprimer ce mail qu'en cas de nécessité

3 11

incompatible types
by Bastien Preuss Nov. 21, 2011

Nov. 21, 2011

Bonjour, Toujours pour la même chose, jai essayé dune autre manière : ArrayList<Integer> strate = new ArrayList<Integer>(); strate.add(2); strate.add(4); MatrixND L = L2.getSubMatrix(1, strate).copy(); Mais jobtiens lerreur suivante : ERROR [pool-2-thread-2] (SimulationService.java:925) finished - Stop simulation plan, because can't call afterSimulation correctly on plan analyseplans.CalibrationSimplexePasVariable2_Saumonee java.util.NoSuchElementException: L'objet passé en argument n'a pas été retrouvé ou la dimension donnée ne convient pas:[2, 4] in [PRO_Occasionnel, <5m_Paita_CHA, <5m_Paita_PALA, <5m_Nou_CHA, <5m_Nou_PALA, <5m_MtD_CHA, <5m_MtD_PALA, >5m_Paita_CHA, >5m_Paita_PALA, >5m_Nou_CHA, >5m_Nou_PALA, >5m_MtD_CHA, >5m_MtD_PALA, Corne_Sud, Nuit_<5_Paita, Nuit_>5m_Paita, Nuit_>5m_Nou, Nuit_>5m_MtD, Nuit_<5m_Nou, Nuit_<5m_MtD, PRO_Regulier] at org.nuiton.math.matrix.MatrixHelper.indexOf(MatrixHelper.java:234) at org.nuiton.math.matrix.AbstractMatrixND.getSubMatrix(AbstractMatrixND.java:7 49) at analyseplans.CalibrationSimplexePasVariable2_Saumonee.afterSimulation(Calibr ationSimplexePasVariable2_Saumonee.java:441) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationService$PrepareSimulationJo b.finished(SimulationService.java:922) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.SimulationJob.run(SimulationJob.java: 251) at java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor$Worker.runTask(Unknown Source) at java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor$Worker.run(Unknown Source) at java.lang.Thread.run(Unknown Source) Bien que le message derreur soit clair, je narrive à résoudre ce problème. Merci de votre aide. Bastien Bastien Preuss Doctorant (PhD Student) IFREMER - IRD - Université de Nouvelle-Calédonie 101 Promenade Roger Laroque BP A5 98848 Noumea cedex New-Caledonia Tel: (+687) 260 723 P afin de contribuer au respect de l'environnement, merci de n'imprimer ce mail qu'en cas de nécessité

1 0

actualisation valeur nb trajets
by Bastien Preuss Oct. 27, 2011

Oct. 27, 2011

Bonjour, Juste pour signaler que lorsque lon modifie la valeur de la durée dune marée, le nombre de trajets ne sactualise pas dans longlet stratégie. Cette valeur est-elle alors correctement calculée dans les simu ? Il faut re-rentrer les valeurs de MinInactivity pour que lactualisation se fasse. Bastien Bastien Preuss Doctorant (PhD Student) IFREMER - IRD - Université de Nouvelle-Calédonie 101 Promenade Roger Laroque BP A5 98848 Noumea cedex New-Caledonia Tel: (+687) 260 723 P afin de contribuer au respect de l'environnement, merci de n'imprimer ce mail qu'en cas de nécessité

3 2

Re: [Isis-fish-users] Ecart entre Obs et Simu après calibration
by Bastien Preuss Oct. 27, 2011

Oct. 27, 2011

Ok, merci Stephanie et Sigrid pour ces précisions. Bastien -----Message d'origine----- De : isis-fish-users-bounces(a)list.isis-fish.org [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] De la part de Sigrid.Lehuta(a)ifremer.fr Envoyé : mercredi 26 octobre 2011 20:43 À : isis-fish-users(a)list.isis-fish.org Objet : Re: [Isis-fish-users] Ecart entre Obs et Simu après calibration Hello, je n avais pas calcule les ecarts en %... c est tres subjectif tout ca... ca depend ce que tu optimises, combien de points etc. Pour la mortalite naturelle par exemple on avait carrement optimise les valeurs du taux de croissance de la population (tendance) plutot que celle de la biomasse point par point et la tu peux avoir un fit parfait. je m etais surtout assuree de la reproduction des patterns saisonniers et des tendances, de l absence de biais systematique, meme si les valeurs absolues etaient parfois un peu eloignees des observations. voici le papier en question (a ne pas diffuser stp) j espere que c est utile. La methode proposee dans le papier permet en tous cas d identifier les forces et faiblesses d une parametrisation. c est un peu l approche que tu as eu en identifiant les echelles auxquelles ca marche bien et celle ou c est moins satisfaisant. pragmatiquement si ca marche bien pour les trucs qui t interessent le + c est cool. pour les autres tu devras etre reserve sur les conclusions. je te recommande Sterman 1984 (pj) pour une bonne definition de "acceptable". Bises Quoting Stephanie MAHEVAS <Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr>: > je ne me rappelle pas quels étaient les ordres de grandeurs Sigrid? > Youen? Benoit? Camille?... > mais dans tous les cas, je ne suis pas sure que cela soit un > indicateur très pertinent car si tu as un gros pics observés que tu ne > reproduis pas tu vas gonfler ton % alors que tout le reste sera nikel, > plus tu augmentent ton pas de temps, plus tu as de chance de gonfler > ton % ..... > steph > > Bastien Preuss a écrit : >> Oui j'ai déjà effectué la calibration de la manière que tu viens de >> décrire, et c'est en utilisant les meilleurs valeurs de q1 et q2 que >> j'obtiens ces écarts d'environs -15% sur la capture annuelle. >> Je me demandais juste si cela semblait correcte par rapport à ce qui >> est obtenu dans d'autres appli Isis. >> >> Bastien >> >> >> >> >> >> -----Message d'origine----- >> De : isis-fish-users-bounces(a)list.isis-fish.org >> [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] De la part de >> Stephanie MAHEVAS Envoyé : mercredi 26 octobre 2011 18:27 À : >> isis-fish-users(a)list.isis-fish.org >> Objet : Re: [Isis-fish-users] Ecart entre Obs et Simu après >> calibration >> >> Question délicate... >> La Palisse te dirait il faut que l'écart soit minimal.... c'est le >> principe de l'optimisation on cherche ici un minimum. Donc >> conditionnellement à ton modèle, tu prends la valeur de q qui >> minimise tes écarts entre obs et simulées. Il est clair que si tu >> changes ton critere en cours de calibration tu fausses l'algorithme. >> Il faudrait dans ce cas utiliser un algorithme d'optimisation >> multi-criteres, mais j'imagine que tu n'as pas le temps d'explorer >> cette piste. >> Donc pragmatiquement, il faut >> 1/ choisir une variable de sortie Y et critere Somme des ecarts au >> carré entre Yobs et Ysimulé, chercher la valeur de q qui minimise cet >> écart 2/ si plusieurs valeurs possibles, identifier d'autres Y (Y' et >> Y") de sortie d'ISIS pour lesquelles tu as des observations et >> confronter à nouveau tes Y'simu et Y"simu à Y'obs et Y"obs. Tu peux >> alors sélectionner la valeur de q qui te semble la plus >> satisfaisante. >> Pour plus de ref, Sigrid a un papier en cours de révision. Elle peut >> peut-etre te le transmettre??? >> bon courage >> stephanie >> >> Bastien Preuss a écrit : >> >>> Bonjour, >>> >>> Une petite questions pour ceux qui ont du recul sur leur(s) >>> application(s) Isis. >>> >>> Je me demande quel écart entre captures observées et captures >>> simulées est acceptable après calibration de la capturabilité. >>> >>> Dans mon cas, ma captures totale annuelle est de +15% par rapport à >>> ma capture observée qui me sert de référence. Bien sur, lorsque que >>> je regarde à un niveau plus fin, par exemple les captures par mois, >>> par stratégie, etc. cet écart varie, généralement entre +-1% et >>> +-97%. >>> >>> Merci. >>> >>> Bastien >>> >>> Bastien Preuss >>> >>> Doctorant (PhD Student) >>> >>> IFREMER - IRD - Université de Nouvelle-Calédonie >>> >>> 101 Promenade Roger Laroque >>> >>> BP A5 >>> >>> 98848 Noumea cedex >>> >>> New-Caledonia >>> >>> Tel: (+687) 260 723 >>> >>> P_ __afin de contribuer au respect de l'environnement, merci de >>> n'imprimer ce mail qu'en cas de nécessité_ >>> >>> >>> -------------------------------------------------------------------- >>> ---- >>> >>> _______________________________________________ >>> Isis-fish-users mailing list >>> Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org >>> http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users >>> >> >> > > -- > ...................................................................... > Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie > et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 > 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| > \ / |__ o _ \ o / o > /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ > / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ > ...................................................................... > _______________________________________________ > Isis-fish-users mailing list > Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org > http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users > -- Sigrid Lehuta Post-doctorante, Institut de Recherche du Golfe du Maine, USA contact : + 1-207-228-1695 / slehuta(a)ifremer.fr / slehuta(a)gmri.org http://www.gmri.org/people/bio.asp?ID=344 Membre de l'Association Française d'Halieutique http://halieutique.agrocampus-ouest.fr/afh/index.html

1 0

Re: [Isis-fish-users] Ecart entre Obs et Simu après calibration
by Bastien Preuss Oct. 26, 2011

Oct. 26, 2011

Oui j'ai déjà effectué la calibration de la manière que tu viens de décrire, et c'est en utilisant les meilleurs valeurs de q1 et q2 que j'obtiens ces écarts d'environs -15% sur la capture annuelle. Je me demandais juste si cela semblait correcte par rapport à ce qui est obtenu dans d'autres appli Isis. Bastien -----Message d'origine----- De : isis-fish-users-bounces(a)list.isis-fish.org [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] De la part de Stephanie MAHEVAS Envoyé : mercredi 26 octobre 2011 18:27 À : isis-fish-users(a)list.isis-fish.org Objet : Re: [Isis-fish-users] Ecart entre Obs et Simu après calibration Question délicate... La Palisse te dirait il faut que l'écart soit minimal.... c'est le principe de l'optimisation on cherche ici un minimum. Donc conditionnellement à ton modèle, tu prends la valeur de q qui minimise tes écarts entre obs et simulées. Il est clair que si tu changes ton critere en cours de calibration tu fausses l'algorithme. Il faudrait dans ce cas utiliser un algorithme d'optimisation multi-criteres, mais j'imagine que tu n'as pas le temps d'explorer cette piste. Donc pragmatiquement, il faut 1/ choisir une variable de sortie Y et critere Somme des ecarts au carré entre Yobs et Ysimulé, chercher la valeur de q qui minimise cet écart 2/ si plusieurs valeurs possibles, identifier d'autres Y (Y' et Y") de sortie d'ISIS pour lesquelles tu as des observations et confronter à nouveau tes Y'simu et Y"simu à Y'obs et Y"obs. Tu peux alors sélectionner la valeur de q qui te semble la plus satisfaisante. Pour plus de ref, Sigrid a un papier en cours de révision. Elle peut peut-etre te le transmettre??? bon courage stephanie Bastien Preuss a écrit : > > Bonjour, > > > > Une petite questions pour ceux qui ont du recul sur leur(s) > application(s) Isis. > > > > Je me demande quel écart entre captures observées et captures simulées > est acceptable après calibration de la capturabilité. > > > > Dans mon cas, ma captures totale annuelle est de +15% par rapport à ma > capture observée qui me sert de référence. Bien sur, lorsque que je > regarde à un niveau plus fin, par exemple les captures par mois, par > stratégie, etc. cet écart varie, généralement entre +-1% et +-97%. > > > > Merci. > > > > Bastien > > > > > > > > Bastien Preuss > > Doctorant (PhD Student) > > IFREMER - IRD - Université de Nouvelle-Calédonie > > 101 Promenade Roger Laroque > > BP A5 > > 98848 Noumea cedex > > New-Caledonia > > Tel: (+687) 260 723 > > P_ __afin de contribuer au respect de l'environnement, merci de > n'imprimer ce mail qu'en cas de nécessité_ > > > > > > ------------------------------------------------------------------------ > > _______________________________________________ > Isis-fish-users mailing list > Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org > http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users > -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ...................................................................... _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users

3 2