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[ANN] - IsisFish 4.1.0.0 released
by forge.codelutin.com Release Notification April 26, 2012

April 26, 2012

The IsisFish team is pleased to announce the isis-fish-4.1.0.0 release! Simulateur de pecherie complexe. Documentation of the project can be found here: http://maven-site.forge.codelutin.com/isis-fish Changes ------- Changes in this version include: New features: o Update to topia 2.6.9 Issue: 823. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. o Update to openmap 5.0 Issue: 650. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. o Update to hibernate 3.6.10.Final Issue: 824. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. o Update to h2 1.3.166 Issue: 821. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. o Update to swingx 1.6.3 Issue: 826. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. o Update to nuiton-utils 2.4.7 Issue: 822. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. o Habitats : Ajout de variables pour repérer les influences sur la dynamique de flottille. Issue: 434. Thanks to Jean Couteau. Resolved by echatellier. o Update to jsch 0.1.48 Issue: 825. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. Fixed Bugs: o Tester R sur caparmor Issue: 733. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. o Nettoyage des RData des AS Issue: 736. Thanks to Jean Couteau. Resolved by jcouteau. o Fix UI simulation list reloading Issue: 919. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. o NPE when updating jobs list table Issue: 1166. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. o Sensitivity export that use Maturity ogive doesn't work since 4.0 Issue: 1165. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. Changes: o Update to freemarker 2.3.19 Issue: 914. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. o Update to commons-math3-3.0 Issue: 944. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. o Update to rsyntaxtextarea 2.0.2 Issue: 1167. Thanks to Eric Chatellier. Resolved by echatellier. Downloads --------- For a manual installation, you can download files here: http://forge.codelutin.com/projects/files/isis-fish * isis-fish-4.1.0.0-bin.zip - http://forge.codelutin.com/attachments/download/363 Have fun! -IsisFish team

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AS Fact Frac
by Bastien Preuss April 24, 2012

April 24, 2012

Bonjour, Jobtiens des résultats dAS qui me paraissent étonnant. Afin dêtre certain que je nai pas fait derreur dans la paramétrisation de mon AS, quelquun pourrait-il 1) me donner les paramètres à entrer pour un plan à 28 paramètres incertains avec 2 modalités (Min-Max) et une résolution III. 2) me confirmer le nom de la méthode dans la liste de linterface qui correspond au plan factoriel fractionnaire. Merci bcp. Bastien Bastien Preuss Doctorant (PhD Student) IFREMER - IRD - Université de Nouvelle-Calédonie 101 Promenade Roger Laroque BP A5 98848 Noumea cedex New-Caledonia Tel: (+687) 260 723 P afin de contribuer au respect de l'environnement, merci de n'imprimer ce mail qu'en cas de nécessité

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Récupération des valeurs de paramètres lors d'un plan d'expérience
by Bastien Preuss April 24, 2012

April 24, 2012

Bonjour jessaie, de récupérer les valeurs des paramètres de mes AS (les vraies pas les codages entre 0 et 1). Jai regardé dans les fichiers « parameter.properties » de chaque simu, mais je ny est rien trouvé de claire. Si non dans le R.data (en PJ) de mon AS, je vois bien les vraies valeurs de Binf et Bsup de chaque param, puis le plan dexpérience, mais là avec le codage 0/1, par contre, je ne trouve pas les valeurs réellement utilisées dans le plan dexpérience. Je me demande donc où je peux trouver cette info, afin de pouvoir vérifier quelle valeur de chaque param a été utilisée lors de chaque simu ? Merci. Bastien Bastien Preuss Doctorant (PhD Student) IFREMER - IRD - Université de Nouvelle-Calédonie 101 Promenade Roger Laroque BP A5 98848 Noumea cedex New-Caledonia Tel: (+687) 260 723 P afin de contribuer au respect de l'environnement, merci de n'imprimer ce mail qu'en cas de nécessité

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Re: [Isis-fish-users] Valeurs de paramètres et résultats d'AS
by Bastien Preuss April 18, 2012

April 18, 2012

J'ai modifié de nouveau tous les getValueandCompute('xx'), en définissant dès ma base les noms de 'xx' même pour les Facteurs de ciblage, de façon à ce que Isis ne les génère pas lui-même lors de la saisie dans l'interface de l'AS. Puis j'ai modifié les noms d'équations, lors de la saisie de chaque facteur dans l'interface d'AS, et là ça fonctionne. Donc comme proposait Eric hier, une petite note dans le manuel serait pas mal, ou modifier le code de manière à ce que Isis génère obligatoirement lui-même les noms mais sans caractère qui pose problème. Après peut être que ce problème n'est plus d'actualité dans la version 4 que je n'utilise pas. Merci pour votre aide les lutins. En espérant ne pas rencontrer d'autre soucis :-) Bastien -----Message d'origine----- De : isis-fish-users-bounces(a)list.isis-fish.org [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] De la part de Jean Couteau Envoyé : mercredi 18 avril 2012 20:47 À : isis-fish-users(a)list.isis-fish.org Objet : Re: [Isis-fish-users] Valeurs de paramètres et résultats d'AS Le 18/04/2012 10:41, Eric Chatellier a écrit : > Jean ? Euh, je donne ma langue au chat ? Plus sérieusement, l'erreur est très étrange. R n'arriverai pas à transformer un data.frame en data.frame, ce qui me semble assez improbable. data<-data.frame(xxxxxxxxxxxxxx) isis.simule<-data.frame(data) <- Erreur ici Donc je pense que le premier data.frame n'a pas été créé et R n'a pas remonté d'erreur. Par contre, à la deuxième instruction il est pas content car data est en fait aussi une fonction R (il va d'ailleurs falloir changer de nom de variable, je ne m'en était pas encore apperçu).... Bastien, comme on a ta base, tu peux nous dire quelle AS tu lances ? (paramètres, facteurs et valeurs). Je vais essayer de reproduire ici tes problèmes et essayer de comprendre pourquoi il ne crée pas le premier data.frame. Jean -- Jean Couteau - Code Lutin - www.codelutin.com 12 Avenue Jules Verne, 44230 Saint-Sébastien-Sur-Loire Tel : 02.40.50.29.28 - Port : 06.68.07.29.29 _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users

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Re: [Isis-fish-users] Valeurs de paramètres et résultats d'AS
by Bastien Preuss April 18, 2012

April 18, 2012

Je viens de tester tous mes param 1 a 1 et l'erreur apparait lorsque j'introduis le Facteur de ciblage d'un de mes métiers dans l'AS. En fait, c'est le seul param où je n'ai pas mis de getvalueAndCompute('xx') à la main, et où j'ai laissé Isis le générer tout seul. Dans le nom généré par Isis il y a des espaces et de accents, donc peut être qu'il n'aime pas, mais même en les enlevant ça bug quand même. -----Message d'origine----- De : isis-fish-users-bounces(a)list.isis-fish.org [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] De la part de Jean Couteau Envoyé : mercredi 18 avril 2012 20:47 À : isis-fish-users(a)list.isis-fish.org Objet : Re: [Isis-fish-users] Valeurs de paramètres et résultats d'AS Le 18/04/2012 10:41, Eric Chatellier a écrit : > Jean ? Euh, je donne ma langue au chat ? Plus sérieusement, l'erreur est très étrange. R n'arriverai pas à transformer un data.frame en data.frame, ce qui me semble assez improbable. data<-data.frame(xxxxxxxxxxxxxx) isis.simule<-data.frame(data) <- Erreur ici Donc je pense que le premier data.frame n'a pas été créé et R n'a pas remonté d'erreur. Par contre, à la deuxième instruction il est pas content car data est en fait aussi une fonction R (il va d'ailleurs falloir changer de nom de variable, je ne m'en était pas encore apperçu).... Bastien, comme on a ta base, tu peux nous dire quelle AS tu lances ? (paramètres, facteurs et valeurs). Je vais essayer de reproduire ici tes problèmes et essayer de comprendre pourquoi il ne crée pas le premier data.frame. Jean -- Jean Couteau - Code Lutin - www.codelutin.com 12 Avenue Jules Verne, 44230 Saint-Sébastien-Sur-Loire Tel : 02.40.50.29.28 - Port : 06.68.07.29.29 _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users

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Re: [Isis-fish-users] Valeurs de paramètres et résultats d'AS
by Bastien Preuss April 18, 2012

April 18, 2012

Bonjour Jean, Comme j'ai modifié tous les getvalueandCompute suite au problème d'hier, je préfère te renvoyer une base : http://upload.codelutin.com/file.php?h=R4a3a09dc55ddbfeca8e4ec7ed341af59 Pour l'AS, je fais un RegFrac avec p=32, r=2 et resolution =3 Concernant les paramètres testés, il y en a pas mal... ça risque d'être un peu long à expliquer. J'essaie de voir si je reproduit l'erreur avec un petit nombre de paramètres. -----Message d'origine----- De : isis-fish-users-bounces(a)list.isis-fish.org [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] De la part de Jean Couteau Envoyé : mercredi 18 avril 2012 20:47 À : isis-fish-users(a)list.isis-fish.org Objet : Re: [Isis-fish-users] Valeurs de paramètres et résultats d'AS Le 18/04/2012 10:41, Eric Chatellier a écrit : > Jean ? Euh, je donne ma langue au chat ? Plus sérieusement, l'erreur est très étrange. R n'arriverai pas à transformer un data.frame en data.frame, ce qui me semble assez improbable. data<-data.frame(xxxxxxxxxxxxxx) isis.simule<-data.frame(data) <- Erreur ici Donc je pense que le premier data.frame n'a pas été créé et R n'a pas remonté d'erreur. Par contre, à la deuxième instruction il est pas content car data est en fait aussi une fonction R (il va d'ailleurs falloir changer de nom de variable, je ne m'en était pas encore apperçu).... Bastien, comme on a ta base, tu peux nous dire quelle AS tu lances ? (paramètres, facteurs et valeurs). Je vais essayer de reproduire ici tes problèmes et essayer de comprendre pourquoi il ne crée pas le premier data.frame. Jean -- Jean Couteau - Code Lutin - www.codelutin.com 12 Avenue Jules Verne, 44230 Saint-Sébastien-Sur-Loire Tel : 02.40.50.29.28 - Port : 06.68.07.29.29 _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users

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Re: [Isis-fish-users] Valeurs de paramètres et résultats d'AS
by Bastien Preuss April 18, 2012

April 18, 2012

Bonjour Eric, J'ai donc modifié les getContextValueAndCompute("xx"), pour que "xx" soit identique au nom que je rentre dans le nom du facteur lors de la saisie du param pour l'AS. Pour un petit plan d'expérience ça semble bien fonctionner à présent. Je poursuit d'autres simu pour vérifier, mais j'ai déjà rencontré une Error. L'AS ne s'est pas lancée et j'ai un message concernant un problème de conversion de Fonction en tableau, mais je ne vois pas exactement d'où ça vient et comment résoudre le pb. Je mets mon début en PJ. Bastien -----Message d'origine----- De : isis-fish-users-bounces(a)list.isis-fish.org [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] De la part de Eric Chatellier Envoyé : mercredi 18 avril 2012 00:25 À : isis-fish-users(a)list.isis-fish.org Objet : Re: [Isis-fish-users] Valeurs de paramètres et résultats d'AS Le 17/04/2012 15:00, Bastien Preuss a écrit : > OK, voici le lien de download : > http://upload.codelutin.com/file.php?h=R9f8443eb39b97fde7cbfe4f9bd9548fe > > > L'AS et la simu faite en exemple, concerne l'espèce Bec de cane, avec les > stratégies : Nuit_Nord; Nuit_Centre, Nuit_Sud ; PRO_Occasionnel et > PRO_Reguliers. C'était un problème entre le nom du getContext("xx") de la base et le setContext("zz") du prescript qui n'était pas egaux, donc les parametres d'AS n'était pas utilisé. C'est peut être un défaut d'isis car il ne peut pas remplacer les getContextValueAndCompute("xx") qui existe déjà dans l'equation. Je vais completer le manuel la dessus. -- Éric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users

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Re: [Isis-fish-users] Valeurs de paramètres et résultats d'AS
by Bastien Preuss April 17, 2012

April 17, 2012

OK, voici le lien de download : http://upload.codelutin.com/file.php?h=R9f8443eb39b97fde7cbfe4f9bd9548fe L'AS et la simu faite en exemple, concerne l'espèce Bec de cane, avec les stratégies : Nuit_Nord; Nuit_Centre, Nuit_Sud ; PRO_Occasionnel et PRO_Reguliers. -----Message d'origine----- De : isis-fish-users-bounces(a)list.isis-fish.org [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] De la part de Eric Chatellier Envoyé : mardi 17 avril 2012 23:40 À : isis-fish-users(a)list.isis-fish.org Objet : Re: [Isis-fish-users] Valeurs de paramètres et résultats d'AS Le 17/04/2012 14:35, Bastien Preuss a écrit : > Le voici! ok, pour le script, mais il à l'air bon. Maintenant, il y a peut-être un pb dans la base. Tu peux me l'envoyer ? -- Éric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users

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Re: [Isis-fish-users] Valeurs de paramètres et résultats d'AS
by Bastien Preuss April 17, 2012

April 17, 2012

Pour les stratégies, c'est plutôt toutes celles dont le nom commence par "Nuit" ou "PRO". -----Message d'origine----- De : isis-fish-users-bounces(a)list.isis-fish.org [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] De la part de Bastien Preuss Envoyé : mercredi 18 avril 2012 00:01 À : isis-fish-users(a)list.isis-fish.org Objet : Re: [Isis-fish-users] Valeurs de paramètres et résultats d'AS OK, voici le lien de download : http://upload.codelutin.com/file.php?h=R9f8443eb39b97fde7cbfe4f9bd9548fe L'AS et la simu faite en exemple, concerne l'espèce Bec de cane, avec les stratégies : Nuit_Nord; Nuit_Centre, Nuit_Sud ; PRO_Occasionnel et PRO_Reguliers. -----Message d'origine----- De : isis-fish-users-bounces(a)list.isis-fish.org [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] De la part de Eric Chatellier Envoyé : mardi 17 avril 2012 23:40 À : isis-fish-users(a)list.isis-fish.org Objet : Re: [Isis-fish-users] Valeurs de paramètres et résultats d'AS Le 17/04/2012 14:35, Bastien Preuss a écrit : > Le voici! ok, pour le script, mais il à l'air bon. Maintenant, il y a peut-être un pb dans la base. Tu peux me l'envoyer ? -- Éric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users

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Re: [Isis-fish-users] Valeurs de paramètres et résultats d'AS
by Bastien Preuss April 17, 2012

April 17, 2012

Le voici! -----Message d'origine----- De : isis-fish-users-bounces(a)list.isis-fish.org [mailto:isis-fish-users-bounces@list.isis-fish.org] De la part de Eric Chatellier Envoyé : mardi 17 avril 2012 23:18 À : isis-fish-users(a)list.isis-fish.org Objet : Re: [Isis-fish-users] Valeurs de paramètres et résultats d'AS Le 17/04/2012 12:26, bastien preuss a écrit : > Pour le script de l'AS, c'est celui par défault que j'utilise, je ne l'ai pas > modifié. Pardon, je parlais de la simulation ou du fichier parameters.properties de la simulation qui contient le prescript en fait. -- Éric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com _______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users(a)list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users

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