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specif du R_Home et Path
by Stephanie MAHEVAS Jan. 23, 2015

Jan. 23, 2015

Avec la version 4.3.1.0, quand on selectionne configuration de R, les champs R_Home et path sont rouges et il est impossible d'y ecrire... Steph -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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selection des parametres dans AS
by Stephanie MAHEVAS Jan. 23, 2015

Jan. 23, 2015

Bonjour impossible de selectionner une variable dans l'interface de selection des parametres d'une AS : java.lang.RuntimeException: java.lang.reflect.InvocationTargetException at jaxx.runtime.JAXXUtil$1.invoke(JAXXUtil.java:264) at $Proxy3.actionPerformed(Unknown Source) at javax.swing.AbstractButton.fireActionPerformed(Unknown Source) at javax.swing.AbstractButton$Handler.actionPerformed(Unknown Source) at javax.swing.DefaultButtonModel.fireActionPerformed(Unknown Source) at javax.swing.DefaultButtonModel.setPressed(Unknown Source) at javax.swing.plaf.basic.BasicButtonListener.mouseReleased(Unknown Source) at java.awt.Component.processMouseEvent(Unknown Source) at javax.swing.JComponent.processMouseEvent(Unknown Source) at java.awt.Component.processEvent(Unknown Source) at java.awt.Container.processEvent(Unknown Source) at java.awt.Component.dispatchEventImpl(Unknown Source) at java.awt.Container.dispatchEventImpl(Unknown Source) at java.awt.Component.dispatchEvent(Unknown Source) at java.awt.LightweightDispatcher.retargetMouseEvent(Unknown Source) at java.awt.LightweightDispatcher.processMouseEvent(Unknown Source) at java.awt.LightweightDispatcher.dispatchEvent(Unknown Source) at java.awt.Container.dispatchEventImpl(Unknown Source) at java.awt.Window.dispatchEventImpl(Unknown Source) at java.awt.Component.dispatchEvent(Unknown Source) at java.awt.EventQueue.dispatchEventImpl(Unknown Source) at java.awt.EventQueue.access$200(Unknown Source) at java.awt.EventQueue$3.run(Unknown Source) at java.awt.EventQueue$3.run(Unknown Source) at java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method) at java.security.ProtectionDomain$1.doIntersectionPrivilege(Unknown Source) at java.security.ProtectionDomain$1.doIntersectionPrivilege(Unknown Source) at java.awt.EventQueue$4.run(Unknown Source) at java.awt.EventQueue$4.run(Unknown Source) at java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method) at java.security.ProtectionDomain$1.doIntersectionPrivilege(Unknown Source) at java.awt.EventQueue.dispatchEvent(Unknown Source) at java.awt.EventDispatchThread.pumpOneEventForFilters(Unknown Source) at java.awt.EventDispatchThread.pumpEventsForFilter(Unknown Source) at java.awt.EventDispatchThread.pumpEventsForFilter(Unknown Source) at java.awt.WaitDispatchSupport$2.run(Unknown Source) at java.awt.WaitDispatchSupport$4.run(Unknown Source) at java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method) at java.awt.WaitDispatchSupport.enter(Unknown Source) at java.awt.Dialog.show(Unknown Source) at java.awt.Component.show(Unknown Source) at java.awt.Component.setVisible(Unknown Source) at java.awt.Window.setVisible(Unknown Source) at java.awt.Dialog.setVisible(Unknown Source) at fr.ifremer.isisfish.ui.input.InputHandler.displayFactorWizard(InputHandler.java:745) at fr.ifremer.isisfish.ui.input.InputHandler.accept(InputHandler.java:724) at fr.ifremer.isisfish.ui.input.InputContentUI$1.actionPerformed(InputContentUI.java:578) at jaxx.runtime.swing.BlockingLayerUI2.acceptEvent(BlockingLayerUI2.java:203) at jaxx.runtime.swing.BlockingLayerUI2.processMouseEvent(BlockingLayerUI2.java:167) at org.jdesktop.jxlayer.plaf.AbstractLayerUI.eventDispatched(Unknown Source) at org.jdesktop.jxlayer.JXLayer$LayerEventController.eventDispatched(Unknown Source) at java.awt.Toolkit$SelectiveAWTEventListener.eventDispatched(Unknown Source) at java.awt.Toolkit$ToolkitEventMulticaster.eventDispatched(Unknown Source) at java.awt.Toolkit$ToolkitEventMulticaster.eventDispatched(Unknown Source) at java.awt.Toolkit.notifyAWTEventListeners(Unknown Source) at java.awt.Component.dispatchEventImpl(Unknown Source) at java.awt.Container.dispatchEventImpl(Unknown Source) at java.awt.Component.dispatchEvent(Unknown Source) at java.awt.LightweightDispatcher.retargetMouseEvent(Unknown Source) at java.awt.LightweightDispatcher.processMouseEvent(Unknown Source) at java.awt.LightweightDispatcher.dispatchEvent(Unknown Source) at java.awt.Container.dispatchEventImpl(Unknown Source) at java.awt.Window.dispatchEventImpl(Unknown Source) at java.awt.Component.dispatchEvent(Unknown Source) at java.awt.EventQueue.dispatchEventImpl(Unknown Source) at java.awt.EventQueue.access$200(Unknown Source) at java.awt.EventQueue$3.run(Unknown Source) at java.awt.EventQueue$3.run(Unknown Source) at java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method) at java.security.ProtectionDomain$1.doIntersectionPrivilege(Unknown Source) at java.security.ProtectionDomain$1.doIntersectionPrivilege(Unknown Source) at java.awt.EventQueue$4.run(Unknown Source) at java.awt.EventQueue$4.run(Unknown Source) at java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method) at java.security.ProtectionDomain$1.doIntersectionPrivilege(Unknown Source) at java.awt.EventQueue.dispatchEvent(Unknown Source) at java.awt.EventDispatchThread.pumpOneEventForFilters(Unknown Source) at java.awt.EventDispatchThread.pumpEventsForFilter(Unknown Source) at java.awt.EventDispatchThread.pumpEventsForHierarchy(Unknown Source) at java.awt.EventDispatchThread.pumpEvents(Unknown Source) at java.awt.EventDispatchThread.pumpEvents(Unknown Source) at java.awt.EventDispatchThread.run(Unknown Source) Caused by: java.lang.reflect.InvocationTargetException at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke0(Native Method) at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke(Unknown Source) at sun.reflect.DelegatingMethodAccessorImpl.invoke(Unknown Source) at java.lang.reflect.Method.invoke(Unknown Source) at jaxx.runtime.JAXXUtil$1.invoke(JAXXUtil.java:257) ... 81 more Caused by: java.lang.RuntimeException: java.lang.reflect.InvocationTargetException at jaxx.runtime.JAXXUtil$1.invoke(JAXXUtil.java:264) at $Proxy7.valueChanged(Unknown Source) at javax.swing.DefaultListSelectionModel.fireValueChanged(Unknown Source) at javax.swing.DefaultListSelectionModel.fireValueChanged(Unknown Source) at javax.swing.DefaultListSelectionModel.fireValueChanged(Unknown Source) at javax.swing.DefaultListSelectionModel.changeSelection(Unknown Source) at javax.swing.DefaultListSelectionModel.changeSelection(Unknown Source) at javax.swing.DefaultListSelectionModel.removeSelectionIntervalImpl(Unknown Source) at javax.swing.DefaultListSelectionModel.clearSelection(Unknown Source) at javax.swing.JList.clearSelection(Unknown Source) at fr.ifremer.isisfish.ui.sensitivity.wizard.EquationContinuousPanelUI.removeSelectedVariable(EquationContinuousPanelUI.java:227) at fr.ifremer.isisfish.ui.sensitivity.wizard.EquationContinuousPanelUI.doActionPerformed__on__remove(EquationContinuousPanelUI.java:408) ... 86 more Caused by: java.lang.reflect.InvocationTargetException at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke0(Native Method) at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke(Unknown Source) at sun.reflect.DelegatingMethodAccessorImpl.invoke(Unknown Source) at java.lang.reflect.Method.invoke(Unknown Source) at jaxx.runtime.JAXXUtil$1.invoke(JAXXUtil.java:257) ... 97 more Caused by: java.lang.NullPointerException at fr.ifremer.isisfish.ui.sensitivity.wizard.EquationContinuousPanelUI.displaySelectedFactor(EquationContinuousPanelUI.java:218) at fr.ifremer.isisfish.ui.sensitivity.wizard.EquationContinuousPanelUI.doValueChanged__on__$ListSelectionModel0(EquationContinuousPanelUI.java:415) ... 102 more -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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version java lancee ?
by Stephanie MAHEVAS Jan. 23, 2015

Jan. 23, 2015

comment je sais si c'est la version 32 ou 64 bits de java qui est lancée? merci steph -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: (33) 2 40 37 41 81 Fax: (33) 2 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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coefficients en % ou valeur absolue dans choix variation AS ?
by Loic GASCHE Jan. 21, 2015

Jan. 21, 2015

Bonjour, Il me semblait que l'interface de choix de la variation à tester dans une AS avait changé : avant on rentrait une valeur en %, et maintenant on doit rentrer une valeur absolue il me semble. Je n'arrive pas à retrouver la discussion que l'on avait eu à ce propos, est-ce que quelqu'un peut confirmer ? Je vais faire une AS de test pour voir de toute façon. Loïc

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tirage d'une valeur dans une loi normale ?
by lgasche＠ifremer.fr Jan. 12, 2015

Jan. 12, 2015

Bonjour, Je souhaiterais faire varier mon recrutement autour de sa valeur de référence. Pour cela j'aurais besoin de tirer une valeur dans une loi normale centrée sur mon recrutement moyen. Existe-t-il un moyen simple de faire ça en java ? Dans la librairie SSJ j'ai trouvé la classe normalGen qui a une fonction qui permet de faire ça, mais je ne pense pas y avoir accès dans une équation de recrutement... Loïc

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Fwd: tirage dans une loi normale en java ?
by Sigrid LEHUTA Jan. 12, 2015

Jan. 12, 2015

hello, je ne l ai jamais fait. mais je suis sure qu'Eric à la réponse. A++ -------- Message transféré -------- Sujet : tirage dans une loi normale en java ? Date : Mon, 12 Jan 2015 10:15:14 +0100 De : lgasche(a)ifremer.fr Pour : Sigrid LEHUTA <Sigrid.Lehuta(a)ifremer.fr> Hello, J'avais oublié de te poser la question vendredi : Sais-tu s'il y a un moyen facile de tirer une valeur dans une loi normale dont on connait la moyenne et l'écart-type en java ? Je sais que dans les AS on peut préciser le type de loi à utiliser et me disais que peut-être on pourrait réutiliser ça, mais ça doit être fait au travers de R. Loïc

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Ressources Isis-fish
by Postmaster ISIS-Fish Jan. 1, 2015

Jan. 1, 2015

Amis utilisateurs d'ISIS-Fish, Ce mail automatique, envoyé tous les 3 mois sur les listes de diffusions du projet, a pour but de vous rappeler toutes les ressources disponibles pour toutes vos éventuelles questions et problèmes. Documentation et manuel utilisateurs ------------------------------------ La documentation d'ISIS-Fish est présente sur le site à cette adresse : http://isis-fish.org/v4/index.html. N'hésitez pas à nous remonter les parties qui ne sont pas claires ou les parties qui ne sont pas à jour, le logiciel évoluant, certaines parties de la documentation sont peut-être obsolètes. Questions et FAQ ---------------- Vous pouvez poser vos questions à cette même liste de diffusion en envoyant un mail à isis-fish-users(a)list.isis-fish.org. Toutes les personnes abonnées le recevront et pourront répondre à vos éventuelles questions. N'oubliez pas, avant de poser votre question, de rechercher parmis les archives de la liste (http://list.isis-fish.org/pipermail/isis-fish-users/) votre question a peut-être déjà été posée. Les questions les plus fréquemment posées sont regroupées sur le site sur la page FAQ : http://isis-fish.org/v4/user/FAQ.html Forge, rapports de bug, suivi des évolutions -------------------------------------------- Si vous rencontrez un bug, vous pouvez vérifier sur la forge ISIS-Fish (http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/issues) si nous en avons déjà connaissance. Si nous n'en avons pas connaissance, vous pouvez nous rapporter le bug, nous l'intègrerons dans la liste des évolutions prévues (http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/roadmap) Pour rapporter un bug (ou une demande d'évolution), donnez nous le maximum de détails sur ce bug (comment vous l'avez obtenu ? votre base, vos paramètres et le fichier debug.txt). Plus nous avons d'informations, plus nous pourrons vous aider simplement. L'équipe ISIS-Fish

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paramètres d'AS qui impactent des simus (hors AS) ultérieures
by lgasche＠ifremer.fr Dec. 12, 2014

Dec. 12, 2014

Bonjour, En testant mes nouvelles relations stock-recrutement, j'ai observé que ma biomasse de sole chutait extrêmement vite, à cause d'une mortalité naturelle très forte (simu réalisée sans pêche). Cette simu était issue d'une AS ou je testais plusieurs valeurs de mortalité naturelle. J'ai refait une AS sur un autre paramètre et ai rechargé une des simus de cette AS pour faire une nouvelle simu. Dans ce cas le taux de mortalité de mes soles était bien plus faible. Il me semble donc qu'en plus des choix des exports de résultats d'autres paramètres issus d'une AS se glissent dans des simus pour les modifier. Serait-il possible de vérifier si c'est effectivement le cas, et si oui de corriger ce problème ? Je ne sais pas comment font les autres mais moi je jongle en permanence entre AS et simu pour tester mes modifications de scripts et vérifier mes résultats, donc c'est plutôt gênant si on ne peut pas faire confiance à ses résultats de simu. Loïc

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Installation ISIS 4.3.1.1
by avigier Dec. 10, 2014

Dec. 10, 2014

Bonjour, J'avais déjà signalé le problème pour une autre version, mais je ne retrouve pas de trace dans les archives. Je suis entrain d'installer ISIS sur un nouvel ordinateur, sous windows 7 avec une version récente de java (7 MàJ 67). Au moment de lancer le .bat, la fenêtre indiquant d'habitude "Isis starting..." s'ouvre et se referme immédiatement. Dans le debug, je récupère ça : " 'java' n'est pas reconnu en tant que commande interne ou externe, un programme ex‚cutable ou un fichier de commandes. " Pourtant, sur un autre ordinateur que j'utilisais hier encore, et où ISIS peut se lancer, j'ai la même version de Java, le fichier .sh est identique. Comment résoudre le problème? Audric

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Arrêt de simulations sous ISIS 4.3.1.1
by avigier Dec. 9, 2014

Dec. 9, 2014

Bonjour, Très gros souci avec mes plans de simus. Tout d'abord, j'ai dû redémarrer mon PC cet après-midi suite à un bug très con (et complètement extérieur à ISIS) qui a complètement freezé mon PC. Une fois de retour sous ma session, je suis allé consulter les historiques de mes plans de simulations, et j'ai constaté que leur dernière MàJ date d'hier soir vers 18h, et non de l'heure du redémarrage du PC, ce qui veut dire que plus aucune simu ne se faisait depuis hier soir. Dans le debug, j'ai vu que, contrairement aux dernières fois où ce bug est survenu, il y avait des dizaines de milliers de lignes d'erreur à a fin (voir PJ). Une idée de ce qu'il s'est passé hier soir? Je relance mes simus ce soir ou demain matin sous la 4.4.0.0 Audric

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